祁连县在“两学一做”学习教育中，加强组织领导，坚持机制创新，强化责任落实，通过建立“三项机制”不断推进学习教育深入开展。
    建立齐抓共管的领导机制。该县县委及时成立“两学一做”学习教育领导小组，下设综合组、宣传组和4个督导组，配齐配强工作人员16名，安排专项经费8万元。各县级领导带头落实“1+10”的联点工作机制，指导联点乡镇、单位开展学习教育工作，解决困难问题36件，筹措资金260万元。各乡镇、各部门积极响应，明确了党委（党组）书记第一责任人的责任，形成了书记带头抓，分管领导具体抓，一级抓一级的工作格局。
    建立特色有效的宣传机制。制定讲好一堂党课、开展一次专题讲座、一次调研、一次学习研讨、一系列微讲堂、一次廉政警示教育和一系列主题活动的“七个一”学习宣传载体。目前，各级党组织书记讲党课87场次，开展辅导培训27场次，参训人员达2500余人次。各级党委（党组）组织开展各类学习讨论70余次，梳理解决产业发展、基础设施建设等方面的问题50余件，开设微讲堂7个，开展宣讲活动10场次，开展廉政警示教育140余次。并开展了“五送五同”“洁我祁连、党员率先”社会公益、祁连先锋志愿服务等10大主题系列活动。同时，各县级领导和乡镇部门主要负责人以现场办公、群众座谈会等方式指导解决问题。
    建立形式多样的督导机制。创新督促检查方式，采取听汇报、专项调研、参加学习讨论等多种方式进行指导，把督促检查的重点放在基层。县委组织部把“两学一做”学习教育情况作为考评的首要内容，并将督促指导贯穿学习教育全过程，在学习教育中完善党员管理长效机制，推广“手机村务通”等品牌做法，解决好流动党员、“口袋”党员的管理难题。